Nørre Aaby har et tæt samarbejde med flere andre kommunale institutioner. 

Middelfart Musikskole bidrager til undervisningen på 0., 1. og 4. årgang med rytmik og blæseinstrumentsundervisning. Musikskolen låner Nørre Aaby Skoles lokaler og laver en gang årligt en skolekoncert. Find mere information om musikskolen på  musikskolens hjemmeside. 

Middelfart Ungdomsskole besøger skolen og laver oplæg om sociale medier på 4. årgang, ung og alkohol på 7. årgang, og rusmidler på 9. årgang. Ungdomsskolen arrangerer Camps for 7.-8. årgang, og Unge-og demokratiarrangement for 9. årgang. Udenfor skoletid tilbyder Ungdomsskole forskellige tilbud til kommunens unge. Læs mere om Ungdomsskolen på  ungdomsskolens hjemmeside. 

Sundhedsafdelingen Middelfart kommune vejleder skolens forældre og personale i forhold til elevernes trivsel og sundhed. På 0. 4. og 8. årgang foretages hvert år Skolesundshedsprofilundersøgelser. Læs mere i Information om skolesundhedsprofiler i Middelfart kommune.   

Uddannelsesvejledningen Middelfart rådgiver skolens elever, forældre og personale i forhold til elevernes valg af uddannelse mv. Læs mere om uddannelsesvejledning på UV-Middelfarts hjemmeside.

SSP kommer på skolen og afholder forældre- og elevmøder for 4. årgang vedr. brug af sociale medier, for 7. årgang vedr. alkohol og for 8. årgang vedr. rusmidler. Løbende afholdes møder mellem alle skoler i Middelfart Kommune og SSP til forebyggelse af kriminalitet, vold, hærværk og misbrug blandt unge. Mere information om SSP kan ses på ssp.middelfart.dk   

Af andre tværkommunale tiltag, som Nørre Aaby skole deltager i, kan nævnes: fælles kommunaleidrætsdage for 4., 6. og 7. årgang, den landsdækkende Edison-konkurrence for 6.-7. årgang, rundvisning og undervisning ved Middelfart Affald og genbrug, og guidede ture med naturvejlederne ved Naturcentret ved Hindsgaul Dyrehave.